Mšice mají velké množství přirozených nepřátel –
pestřenky,
slunéčkovití s mnoho druhů z řádu blanokřídlých (
Hymenoptera). Zejména při slabém výskytu, který je však z hlediska přenosu virů také nebezpečný, je účinnost přirozených nepřátel vysoká.
Při zjištění kolonií mšic je vhodné v závislosti na tom, zda jsou rostliny pěstovány v uzavřených nebo otevřených podmínkách využít přirozených nepřátel mšic, viz výše, nebo využít komerčně dostupných preparátů na bázi parazitoidů (
Aphidius spp.,
Aphelinus sp., Praon sp.) nebo predátorů (
Aphidoletes sp., Chrysopa sp. a
Macrolophus spp.). V boji proti mšicím se dále se uplatňují přípravky na bázi entomopatogenních hub např.
Lecanicillium spp. nebo
Beauveria spp. V přírodě jsou mšice dále napadány houbami rodu
Enthomopthorales. Aby byly přípravky na bázi hub účinné, je nutné zajistit dostatečnou vlhkost po aplikaci.
Také výtažky rostlin z tabáku nebo citrusů vykazují aficidní účinky. Proti mšicím je možné využít též přípravky na bázi azadirachtinu. Ošetření je nutné opakovat a využít při aplikaci smáčedla, která narušují voskový povrch těla mšic.